扇平呈現比溪頭內容更豐富的自然森林教室（日治時代為育種苗圃），氣候涼爽宜人，年平均溫度約攝氏21度，天然條件良好，構成豐富穩定的植物生態系，

扇平森林生態科學園為了防範自然生態受到破壞，所以遊客入山最好能採團體制事先預約而為了以免涉險、迷途，園方會有安排義工解說員服務導覽且能藉由導覽解說，了解人造與天然林區的動植物生態。憑身分證辦理乙種入山証。